シェルフのサムネイルが見慣れたものと異なるように見える場合は、プレビューのレンダリングに使用されたシェーダが原因かもしれません。

1 - メインとなる設定ウィンドウを開きます。

2 - シェルフプレビューシェーダを削除します。

Generalにて、"Preview options"セクションが表示されるまでスクロールダウンします。
Material preview shaderの前にある十字ボタンをクリックして、指定した現在のシェーダを削除します。

3 - Substance Painterを再起動する

サムネイルを再生成して正しく見えるようにするには、Substance Painterを再起動する必要があります。