この症状が発生した時は、下記の手順をお試しください。
- After Effects でサポートされているファイルを開いてください。(例:.aepファイル)
- After Effects が起動し、プロジェクトファイルが開くことを確認してください。
- 編集メニューの「環境設定」 > 「一般設定」を開き、「ホーム画面を有効化」をオフにして「OK」を押してウィンドウを閉じてください。
- After Effects を一度終了し、デスクトップアイコンなどのショートカットをクリックしてAEを再起動し、正常に起動するか確認してください。

(補足)起動と修復について:https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/using/preferences.html#startup-and-repair