Mayaの既定の設定では、ジョイントのスケールを編集した時に、子供には伝播しません。
下の図ではjoint4のスケールを編集していますが、スケールが変化しているのはjoint4のみでjoint5以下のスケールには伝播していません。

　

スケールを編集するジョイントの子のジョイントを選択して【アトリビュートエディタ】> ジョイント > セグメントスケール補正＝OFF とすると、これより以下のジョイントに親のスケールが伝播します。
下記の図ではjoint5で前述の設定を行うことで、joint4のスケールをjoint5～8に伝播しています。

この設定は直接の親のスケールのみが伝播しますので、図のようにjoint1のケールを編集した場合はjoint5以下にこの編集は伝播しません。