こちらはToolkitでディレクトリ構造の変更を行った場合に発生する例です。
最初にデータをSaveすることはできたのに、継続して作業をして
Saveをしようとしても、Shotgun Workfilesのメニューが表示されない場合があります。
本来はこのように表示されます。
Publish後にShotgun Workfilesが見当たりません。
こちらが表示されない場合は、Configフォルダ内のSchema以下の設定において、
Publishフォルダ以下が存在していないか、step.ymlの設定がうまく行っていない
可能性が高いです。
デフォルト設定の例では
shots/{Episode}/{Sequence}/{Shot}/work/{Step}
shots/{Episode}/{Sequence}/{Shot}/publish/{Step}
の階層にstep.ymlが存在しています。
まずは、該当の階層にデータが存在しているか確認してみてください。